选择聚氨酯或聚脲防水涂料，首先需要考虑的是采用脂肪族体系还是芳香族体系。脂肪族体系的原料成本相对昂贵，但它们的耐紫外光性能和颜色稳定性却是所有工业涂料中好的，因此它们通常使用在户外或者对颜色稳定性要求较高的地方;而芳香族体系的原料成本相对便宜，它们通常应用在室内或地下涂装，因为当芳香族体系的涂料暴露在曝光下数月甚至数天后，会泛黄变色，影响外观。但在一般情况下，颜色泛黄后并不会明显损害涂层的物理和力学性能。
在聚氨酯体系中，溶剂型涂料已经被非溶剂型(或低溶剂型)淘汰，它们在性能上和使用方法上已没有区别。聚氨酯的单组分体系与双组分体系在使用方法上前者属于“傻瓜型”，使用方便，但性能调节的宽容度小;而后者使用灵活，可更多地根据需要，在工厂甚至现场进行调节。
喷涂聚脲防水涂料与聚氨酯防水涂料在多数情况下可以通用，但前者更适合于规模较大，并且对防水材料综合性能要求较高的工程应用，当然对施工队伍技术水平要求也相应较高。而后者更适合机械施工不方便的场合。特别需要指出的是，当旧的混凝土结构维修翻新后需再次涂敷防水材料时，由于此时的混凝土会含有大量的污渍，从粘结力角度考虑，这种情况下更适合选择聚氨酯涂料。(文章来源本站)
后还要考虑聚氨酯或聚脲体系双组分的混合比例。一般情况下，2个组分的体积混合比为1:1，但也有少数是采用活性氢组分与异氰酸酯组分的体积比大于1:1的。就保证混合效果和材料性能而言，1:1的比例是容易控制的方法，异于这个比例，就容易引起混合计量的误差。当2个组分的混合比例相差越大，引起计量误差的可能性也就越大。因此，选择并保证正确的混合比例也是保证涂料性能的重要因素。